Grunnaðgerðaraðferð CNC fræsunarvélar felur venjulega í sér að kveikja á, fara aftur á viðmiðunarpunkt, inntak forrits, klemma vinnustykki, stillingu verkfæra, vinnslu og slökkva á. Fylgja verður öryggisaðgerðum við notkun, svo sem að klæðast viðeigandi hlífðarbúnaði og nota neyðarstöðvunarhnappinn rétt. Stjórnborð CNC kerfisins samanstendur venjulega af CRT skjá, MDI spjaldi og stjórnborði véla. Forritun er nauðsynleg kunnátta til að stjórna CNC fræsivél, sem felur í sér bæði handvirka og sjálfvirka forritun.
Val á skurðarbreytum verður að fylgja ákveðnum meginreglum: grófgerð miðar að háum málmfjarlægingarhraða, en frágangur miðar að háum yfirborðsgæði. Hægt er að reikna út lykilbreytur eins og skurðhraða Vc og töflumatarhraða F með formúlum.
